接下来的半年时间，阿尔宙斯公司进入了静默期。
没有什么新的动向，只是每周稳定更新着动画与漫画。
漫画的叙事视角从小金小银身上暂时退场，转到了小赤身上。
在四天王事件之后，坂木不知去向，小赤本来通过考核接替了常磐道馆的馆主身份，却又因为旧伤不得不将职责托付给小绿。
小绿将自己的喷火龙借给了小赤，让他去往白银山好好养伤。
当然，这只是一个小插曲。
小金小银被假面男打到下线之后，水晶篇章到来。
水晶篇章的女主一克丽丝塔儿，一个被称作“捕获专家”的少女，能够灵活运用任何种类的精灵球。这位被大木博士寄予厚望的少女，在追捕水君的过程中，意外揭开了假面男庞大阴谋的一角。这时期，其实已经有一部分观众开始怀疑假面男的真实身份是柳伯了。
只因在水君挑战各大馆主的时候，柳伯将水君的冰雕用谎言圆了过去，暴露出了自己有一只信使鸟。要知道，信使鸟可是假面男的招牌宝可梦。
不过，看着柳伯那一副和蔼的表情以及矮小的身材，至少一半的人都认为只是巧合罢了。
一时间，阿尔宙斯社区因为柳伯到底是不是假面男的问题争议不断。
与此同时，炎帝复活了小金小银，两人于漩涡岛与克丽丝塔儿首次联手。
合力对抗在漩涡岛复苏而来的洛奇亚，他们三人的御三家皆是在战斗中进化成了最终形态，分别是大力鳄、火暴兽与大竺葵！
然而，当三人齐心协力，击败洛奇亚并准备收服它的时候，意外发生了，这只洛奇亚竟然已经被人收服过了！
这让看到这里的粉丝们忍不住倒吸一口凉气。
就连三个主角都需要齐心协力才能勉强击败的洛奇亚，竟然早就被人收服了？
假面男！
所有观众都意识到，除了假面男之外，还有谁可以凭借一人之力收服洛奇亚？
就在这时，宝可梦协会举办了一场馆主之间的对战，目的就是为了找出假面男的真实身份。这让粉丝们非常期待，他们已经迫不及待的想要看到假面男到底是谁了。
可是，就在16个馆主在一起进行对战之时，视角竟然转到了另一边，假面男正乘着自己的信使鸟，来到了铃铛塔，说要让凤王再次成为他的工具！
粉丝们纷纷感觉自己受到了欺骗，无数个谜团再次出现。
？？？？？
“说好的假面男是道馆馆主呢？”
“空木博士骗我们干嘛啊，16个馆主都在石英高原，总不能是下一个地区的馆主吧。”
“就是就是，假面男明明另有其人。”
“假面男说要让凤王再次成为他的工具，什么意思？他这是要干嘛？”
故事还在继续，一群被假面操控的火箭队乘坐着列车，向石英高原发起了进攻，道馆馆主们立即上车进行阻击。
可这样一来却是中了假面男的调虎离山之计，只见列车上烟雾四散，列车车门突然关闭，迅速驶离石英高原。
假面男趁机带着凤王和洛奇亚来到这里，更是称这两尊神圣的神兽为奴仆！
小金和克丽丝塔儿齐心协力，奋力抵抗，最终却是不敌假面男。
随后，假面男抓住了制作精灵球的钢铁大师和他的孙女，逼迫他制作出能够抓捕时间的精灵球。观众们恍然大悟。
根据游戏和电影中的剧情，观众们基本已经推测出假面男是要干什么了。
虽然动画、游戏和漫画都是独立的剧情，但是肯定是有一些共通性的。
假面男一定是想抓捕栎树林之中的雪拉比！达成穿越时空的目的！
故事来到这里，显然是已经来到了高潮。
钢铁大师依旧不愿意帮假面男制造能够捕捉时间的精灵球。
假面男只好动手搜身，抢走了一本精灵球制作秘籍，在秘籍的最后一页，赫然就是GS球的制作方法。与此同时，另一边，在列车之上，馆主们齐心协力，击败了这些被面具操控的火箭队，让列车停了下来就在假面男即将启程栎树林，完成自己计划的时候，小霞、马志士和夏伯携手三圣兽重返石英高原。不同于游戏和动画，漫画中每一位馆主的实力都非常强大。
他们配合三圣兽，与假面男展开了一场大战，由马志士和夏伯引开了凤王和洛奇亚，小霞和水君限制住了假面男的行动。
然而，就在所有人认为假面男已经无路可跑时，假面男竟然硬生生扯断了自己的下半身，打了馆主们一个措手不及！
他的下半身更是钻出一只鬼斯，将馆主们拖住，假面男则驱使着凤王洛奇亚，还有信使鸟飞离了这里，朝着栎树林前去。
“啊？？？不是哥们，你是什么生物啊？”
“什么鬼，这是恐怖漫画？断了半截身体还能完好无损啊？”
“下半身藏了一只鬼斯，上半身难不成也是宝可梦？”
“假面男刚才甚至吃了雷公一炮，被轰穿了都完好无损，就离谱！”
“你哪怕是换动画里的小智来也已经死八百回了吧。”
“之前的反派坂木