拼凑出一个大致的故事。
一个强大的飞天三头骷髅头魂兽消灭了城市，它造成的爆炸让城市下沉。这座还算保存完好的城市地下又诞生了一种可以根据声音寻找到魂师的古怪魂兽，这只魂兽力大无穷、免疫火焰，能轻松杀死封号斗罗。文明的宝藏都被留在了这座失落的地下城市里，那里藏着事关飞天骷髅魂兽的秘密与信息。不仅是失传的魂导器和魂导器制作技术，还有很多关于奇怪魂兽的线索在里面等待比比东去了解。要是召唤出的这个东西不对劲，自己无法控制的话，那可就要慎重考虑了。
但是如果这个强大的魂兽是可以被控制的 .. ..比比东自信现有的武魂殿实力加上可以轻松灭城的强大魂兽绝对能消灭一切反对者，实现她组建“武魂帝国”的愿想。
届时，大陆一统，她将成为独一无二的女皇。